2005年9月由教育部批准建设，建设投入2000万元，经过两年的建设于2008年2月正式通过教育部的验收，并正式向社会开放运行。经进一步建设凝练，2019年实验室更名为“水产生物技术教育部重点实验室”，研究方向调整为：水产动植物遗传育种与增养殖、水产动植物免疫与病害防控、水产养殖动物营养与饲料、渔业生态与环境保护、水产资源与挖掘利用等5个方向。实验室围绕国家乡村振兴战略、国家现代农业种业振兴计划与国家加快推进水产养殖业绿色发展的意见，结合国家现代农业产业技术体系，以产业需求为导向，充分利用浙江省海洋经济结构特点和资源优势，本着“立足宁波、服务浙江、走向全国，突出重点、讲求实效”的原则，聚焦东海区混水区环境与特色水产养殖种类，致力于基础研究与应用研究，引领与支撑浙江及全国水产养殖业。
